センターは（1）所长（2）副所长（3）运営委员（4）研究调査员（5）事务长及び事务职员によって构成される。
センターの事业内容やその运営等は、大学史料センター运営委员会により决定される。委员会は所长を委员长、副所长を副委员长とし、各运営委员は本学教职员の中から运営委员会が総长に推荐し、理事会において任命される。运営委员には、职务上の委员として総务部长、大学史资料センター事务长が含まれる。运営委员の任期は２年。委员は2005年现在９名である。
研究委员は、必要に応じて本学教员の中から所长が运営委员会の同意を得て委嘱する。
センターに関する事务は、総务部大学史资料センター事务室が行う。室员としていわゆる専门职员が置かれ、各种事务事业を行うと同时に、资料収集、调査研究活动に従事している。现在は事务长を含む専任职员は４名である。また必要に応じて嘱託职员が置かれることとなっている（2005年现在２名）。
